Troya Müzesi’nin yaklaşık 300 m doğusunda yer alan Çıplak bölgenin en eski köylerindendir. Köyün içinde yer alan Çıplak Dede mezarının köye ismini veren kişiye ait olduğu söylenmektedir. Birçok köylere ismini veren, elinin emeği ve alnının teriyle dağ başlarında yer açıp yerleşen, bağ ve bahçe yetiştiren ve batıya doğru Türk akınlarının temelini atan dervişler gibi Çıplak Dede’nin de “Kolonizatör Türk Dervişleri”nden biri olduğu düşünülmektedir. 1530 Biga Livası Haritası’nda yer almayan Çıplak Köyü, 1798 tarihli Lechevalier’in haritasında yer almakla beraber kuruluş tarihinin daha eskiye gittiği düşünülmektedir. Ayrıca Troya’yı kazan Schliemann1870 yılında kısa bir süre burada kalmıştır.